试剂盒采用柱式提取和改良碱裂解法相结合,适合于从 1~7mL 培养过夜的大肠杆菌培养液中提取高达 50µg 高纯度质粒 DNA。纯化的质粒可直接用于测序、酶切、PCR、转化、文库筛选,转染常规传代细胞等应用。本产品对碱裂解进行了优化,可以在 8 分钟内完成数个样品提取工作。质粒产量纯度与宿主菌的种类、培养条件、拷贝数、质粒结构等因素相关。
产品信息
| 产品名称 | 货号 | 规格 |
| 快速质粒小提试剂盒 | HSM010011-01 | 50T |
| HSM010011-02 | 200T |
产品组分
| 组分 | HSM010011-01 | HSM010011-02 | 主要组 分 | 组分功 能 |
| 包装次数 | 50次 | 200次 | / | / |
| RNaseA | 50μL | 200μL | 核糖核 | 降解 |
| Buffer | 3mL | 12mL | 酸酶A NaOH | RNA 激活柱 |
| BCL Buffer | 12mL | 45mL | Tris/ | 子 菌体重 |
| P1 Buffer P2 | 12mL | 45mL | EDTA NaOH | 悬 碱裂解 |
| Buffer BP3 | 22mL | 90mL | 盐酸胍/ 醋酸/异 | 结合液 |
| Buffer | 15mL | 60mL | 丙醇 盐酸胍/ | 除蛋白 |
| PWA Buffer PW2 | 6mL | 25mL | 异丙醇 Tris/ NaCl | 质 除盐离 子 |
| Elution Buffer | 10mL | 30mL | 10mM Tris, | 洗脱液 |
| 纯化柱 | 50 | 2×100 | pH8.5 玻璃纤 | 吸附核 |
| C3 2mL收 | 50 | 2×100 | 维滤膜 收集管 | 酸 收集滤 |
准备事项
(1) 短暂离心 RNaseA,把全部 RNase A 转移至 Buffer P1 中,2-8℃保存,有效期为 6个月。
(2) 按瓶子标签所示,加入 4 倍体积的无水乙醇稀释 BufferPW2,于室温保存。
(3) 纯化柱 C3 最高载量可达到 50µg,受湿气温度等贮藏条件影响,吸附柱最高结合力会下降,超过生产日期 6~8 个月或产量异常时,建议激活柱子以提高柱子最高载量,实验前将纯化柱 C3 装在收集管中,加入 50μL BufferBCL 至柱子滤膜上,静置 10~30 分钟。
(4) 低温下,Buffer P2 中的 SDS 会析出,使用前 37℃水浴使沉淀完全溶解。
实验流程
1. 菌体收集:13,000×g 离心 1 分钟,收集1~7mL 培养过夜的大肠杆菌培养液(LB 培养基),倒弃培养液,反扣于吸水纸上轻轻拍打吸尽残液。培养方法:在无菌条件下,用灭菌牙签挑取一单菌落,转移 1-7mL 含相应抗生素的 LB 培养液中,37℃摇床(200-300rpm)培养 12-14 小时。培养管或培养瓶容量最好超过培养液体积的 4-5 倍。2×YT 或 TB 培养液因菌体密度很高,菌液用量不应超过 2.5mL。2×YT 或 TB 培养液中菌体生长速度过快,不利于质粒充分复制,应尽量避免使用。纯化柱C3最大结合力为50µg,超量DNA因无法吸附而随滤液流出。处理低拷贝载体,菌液用 量 可 以 达 到 10~15mL, 扩 大BufferP1/P2/BP3 的体积。
2. 菌体重悬:加入 200μL BufferP1/RNaseA,高速涡旋让菌体充分分散。使用前确保 RNase A 已加到 BufferP1 中。充分重悬细菌对产量很关键,重悬后应看不到明显的菌块。若涡旋未能充分打散菌块,用移液器吸打数次。未能打散的菌块会影响裂解而造成产量和纯度降低。
3. 菌体裂解:往重悬液中加入 200μL BufferP2,温和上下翻转 6~8 次使菌体充分裂解。涡旋或振荡会造成基因组污染。混匀后溶液应变得粘稠而透亮。若菌体较多时室温放置 2~3分钟,其间再颠倒几次以充分裂解。若溶液未能变得清亮,可能菌体过多而裂解不彻底,下次实验减少菌体用量或增加 Buffer P1,BufferP2 和 BufferBP3 用量。
4. 菌体中和:加入 400μL BufferBP3,立即快速上下颠倒混匀 10~15 次让溶液中和。加入BufferBP3后应立即快速上下颠倒混匀,以避免产生局部沉淀。当菌体用量较多或过量时,增加混匀次数以充分中和。
5. (可选)去除杂质:13,000×g 离心 1 分钟。处理中高拷贝载体时可省略离心步骤,沉淀同试剂可以直接转移至柱子中,变性的基因组DNA 和蛋白离心后会在膜上形成致密的沉淀物,在第 10 步洗脱时不会被洗脱出来,不影响 DNA 的纯度和浓度。
6. 过柱纯化:将纯化柱 C3 装在收集管中,把上清液或混合液转移至柱子中,13,000×g 离心 1 分钟。生产日期超过 6 个月或产量异常时,建议加入50μL BufferBCL 激活柱子提高载量。
7. 除蛋白:倒弃滤液,把柱子套回收集管中。加入 250μL BufferPWA 至柱子中,13,000×g 离心 1 分钟。
8. 脱盐:倒弃滤液,把柱子套回收集管中。加入 500μL BufferPW2 至柱子中。13,000×g 离心 1 分钟。
9. 干燥:倒弃滤液,把柱子套回收集管中。13,000×g 离心 1 分钟甩干柱子。
10. 洗脱:把柱子套在 1.5mL 离心管(自配)中。加入 50~100μL ElutionBuffer 或灭菌水至柱子的膜中央。静置 1~2 分钟,13,000×g离心 1 分钟洗脱 DNA。弃去柱子,把质粒保存于-20℃。
OD 值测量和产量
(1)基座清洁:打开微量分光光度计,取 2μL ElutionBuffer 或灭菌水加到基座上,将样品臂放下,浸泡 2 分钟,用无尘布将检测基座擦拭干净。
(2)调零:基座清洁后,加入 2μL ElutionBuffer 进行调零后,用滤纸吸去液体。
(3)测量:混匀样品,取 2ul 待测样品进行测量,用滤纸吸尽液体,进行第二个样品测量,最后用灭菌水清洗完毕。
本产品得率的质粒 DNA:
A260/280 比值:本产品正常值为 1.80~1.95。若 A260/280 超过 2.0,说明存在 RNA 污染,请检查 P1/RNase A 有效期,或避免使用 2×YT 或 TB 等富含营养的培养液。
A260/230 比值:本产品正常值为 1.8~2.5。
电泳检测
(1)配制 0.8-1.0%琼脂糖凝胶,取 0.5-1µg质粒 DNA(约 0.5-3μL)进行电泳分析。电泳后有时会出现三条或甚至三条以上的 DNA 条带,有时会有两条,甚至只一条带的情况。这种情况与电泳上样量、培养时间、质粒结构都有关系。
(2)电泳后经典的三条 DNA 条带是指超螺旋、线性 DNA 和开环 DNA,其中超螺旋最快,含量越高越好。
常见问题
1. DNA 产量低
(1)质粒拷贝数:载体因拷贝数差异会造成质粒产量明显的波动。高拷贝数的载体常有 2~3倍的产量波动,(每毫升培养过夜的菌液,高拷贝数的质粒载体产量为 3~16µg)。长片段质粒(>7kb)和表达型载体常以中低拷贝数为主,每毫升菌液的产量约为 0.5~2µg。
(2)菌种问题:菌种保存过程中存在质粒丢失现象,养菌前最好先划线活化,以稳定产量。
(3)细胞未充分裂解:细菌须在 BufferP1/RNase A 中充分重悬,成团的细菌因无法裂解会降低产量。
(4)试剂准备有误:BufferP2 若有沉淀析出需加热溶解。
(5)长片段质粒(>10k bp):处理长片段的质粒 DNA,建议使用质粒小提试剂盒(经典型),或者将 BufferBP3 换成 BufferP3。
2. 基因组 DNA 污染
(1)培养时间太长:菌液培养时间需控制在12~16 小时。
(2)裂解问题:加入 Buffer P2 时,必须轻柔颠倒混匀;处理多个样品时,从加入 BufferP2 时算起,总时间不要超过 4 分钟。
3. 下游实验结果不理想
(1)质粒降解:用 end A+的菌株如 HB101或其它野生型菌株,含有高丰度的核酸酶,最好使用 HiPure PlasmidPlus Kits 系列。
(2)膜脱落:硅胶膜在离心过程中可能会发生脱落。脱落到质粒中硅胶膜是不溶解的。13,000×g离心2分钟后再把质粒转移至新的离心管中。
4. 中和后离心得不到上清
(1)盐析出:加入 Buffer BP3 中和后,不能低于 10℃离心。低温时,上清会有大量的盐析出而造成堵柱。若室内温度过低,可将BufferBP3 平衡至 37~50℃后使用。得到的上清要尽快过柱。
注意事项
本产品仅限于科学实验研究使用,不得用于临床诊断、治疗等领域。
