本文提供了用于 N-糖快速酶释放和快速标记的 N-糖分析试剂盒的常规维护和使用信息。本方案使用单克隆抗体进行了验证,并且已经过测试,适用于多种其它 N-联糖蛋白。我们建议用户对自己特定样品的酶释放进行确认。
产品信息
| 产品名称 | 货号 | 规格 |
|---|---|---|
| N-糖分析试剂盒 | HBP003103 | 24 个样/盒 |
产品性质
| 模块 | 组分 | HBP003103 |
|---|---|---|
| 糖基释放模块 HBP003103-1 | IgG | 1.2 mg |
| PNGase F酶 | 45µL | |
| PNGase F缓冲液 | 0.5mL | |
| 表面活性剂 | 1.2mg*6 | |
| 标记模块 HBP003103-2 | 标记物 | 8.2mg*3 |
| 无水DMF | 1mL | |
| 纯化模块 HBP003103-3 | 固相萃取小柱 | 8支/包*3 |
| 洗脱缓冲液 | 5mL*1 | |
| 样本稀释液 | 5mL*1 | |
| 收集模块 HBP003103-4 | 8连排反应管 (200μL) | 100个 |
| 8连盖 | 100个 | |
| 废液盘 | 1个 |
运输及保存方法
| 名称 | 保存条件 |
|---|---|
| IgG | 2-8℃,12个月 |
| PNGase F | -25~-15℃,12个月,避免反复冻融 |
| PNGase F缓冲液 | 2-8℃,12个月 |
| 表面活性剂 | 常温,12个月 |
| 标记物 | 2-8℃,12个月,避光 |
| 无水DMF | 常温,12个月 |
| 洗脱缓冲液 | 常温,12个月 |
| 样本稀释液 | 常温,12个月 |
| 固相萃取小柱 | 常温至效期末,未使用完的小柱密封保存 |
| 200μL 8连排反应管、8连盖、96孔收集板、废液盘 | 常温至效期末。 |
使用说明
在启动本方案之前,用户需自备如下试剂和设备(以 1 个 IgG(I4506)样本为例):
(1) 0.85%氯化钠溶液 100µL;乙腈(LCMS 级);超纯水;
(2) 15/85=超纯水/乙腈溶液(v/v),2mL; 1/9/90=甲酸/超纯水/乙腈(v/v),20mL; 50 mM 甲酸铵,pH=4.4,500mL;
(3) SPE 真空泵;固相萃取装置;加热模块或金属浴(90℃和 50℃);涡旋仪;移液枪。
第一步:快速糖基释放
(1)称取 IgG 样品粉末于 0.85%氯化钠溶液或超纯水中,使得 IgG 终浓度为 2mg/mL(此处为推荐浓度,可根据实际样本情况调整浓度)。
(2)糖基释放缓冲液:溶解 1 瓶表面活性剂(1.2mg)于(24μL)的 PNGase F 缓冲液中,混匀室温放置(该缓冲液现配现用)。
(3)取 20μL IgG 溶液加入 200μL 反应管中,加入 3μL 糖基释放缓冲液,吸打混匀后,再加入 3.3μL 超纯水,抽吸和分散使其混匀。
(4)将上述混合物于加热模块中 90℃,3 min,使其变性,取出,置室温冷却 3min。
(5)再加入 1.2μL PNGase F,抽吸和分散使其混匀,于加热模块中 50℃孵育该混合物5min。在此等候过程中,可配制标记试剂。
(6)反应完成后取出,室温冷却 3min。
第二步:快速标记糖基
(1)标记试剂:溶解 1 瓶标记(8.2mg)于(60.13μL)无水 DMF 中,该标记试剂现配现用),抽吸和分散溶液 5-10 次,以完全溶解。
(2)向反应管加入 6 μL 标记试剂溶液,抽吸和分散 5 次确保混匀,室温下反 5min。
(3)加入 179 μL 乙腈,混匀用于纯化。
第三步:纯化
(1)安装固相萃取装置。
(2)活化:用 200μL 超纯水加入萃取小柱进行活化,废液盘收集。
(3)平衡:用 200μL 15/85 的水/乙腈溶液对小柱进行平衡,废液盘收集。
(4)上样:加载乙腈稀释的样品,废液盘收集。
(5)用 600μL 的 1/9/90 的甲酸/超纯水/乙腈对小柱进行清洗两次至废液盘。
(6)取走废液盘,更换为洁净的 1.5mL 离心管。
(7)用 50μL 的洗脱缓冲液加入小孔,洗脱糖基至离心管,洗脱 2 次。
(8)加入 200μL(建议量,具体可根据样本,检测设备等进行调整)的样本稀释液,混匀,待上机检测。
第四步:HILIC-FLR 检测分析
(1)色谱柱 ACQUITY UPLC® Glycan BEH Amide, 130 Å, 1.7 μm, 2.1 x 150 mm(waters 部件号 186004742)。
(2)柱温: 60 °C。
(3)流动相 A:50 mM 甲酸铵(推荐使用LC-MS 级)溶液,pH=4.4。
(4)流动相 B:100%乙腈(推荐使用 LC-MS 级)。
(5)流速:0.4 mL/min;
(6)梯度:
| 时间(min) | 流速(mL/min) | %A | %B | 曲线 |
| 0 | 0.4 | 25 | 75 | 6 |
| 35 | 0.4 | 46 | 54 | 6 |
| 36.5 | 0.2 | 100 | 0 | 6 |
| 39.5 | 0.2 | 100 | 0 | 6 |
| 43.1 | 0.2 | 25 | 75 | 6 |
| 47.6 | 0.4 | 25 | 75 | 6 |
| 55 | 0.4 | 25 | 75 | 6 |
(7)FLR 波长: EX 265/EM 425 nm;
(8)FLR 采样速率: 2 Hz,
(9)进样体积: 10μL(建议量,具体可根据样本,检测设备等进行调整)。备注:以上参数基于配备“ACQUITY® RDa”检测器的 LCMS,用户根据设备调整适当的参数。
注意事项
• 对于中间产物体系中含有柠檬酸盐、醋酸盐、磷酸盐、Tris、SDS;或体系 pH<4 或 pH>9,使用本试剂盒时,若出现轻微沉淀影响测值情况下,建议对样本体系进行溶液置换。
• 置换操作流程:(以下建议基于实验设备:DLAB,型号:D1624R,因设备、耗材、样本不同,可根据实际情况调整,比如时间、转速等)
(1)准备 10kD 的超滤离心管,加入 150μL 超纯水,≥13000rpm 离心 5min(若发现超滤管残留体积较大,该超滤管异常,及时更换新的超滤管重复此操作)。
(2)取300μL样本溶液至10kD过滤管中12000rpm离心3min,去掉下层液体,向上层截留溶液中加入300μL超纯水12000rpm离心3min,再重复两次,吸取全部上层截留溶液至离心管中(或为了将液体转移干净,可将内管倒置于新的外管,12000rpm离心3min)(可测试蛋白浓度,并调整至合适浓度,进行N-糖的测试)。
• 或提高转速按如下操作:
(1)准备 10kD 的超滤离心管,加入 150μL 超纯水,≥13000rpm 离心5min(若发现超滤管残留体积较大,该超滤管异常,及时更换新的超滤管重复此操作)。
(2)取300μL样本溶液至10kD过滤管中14000rpm离心2min,去掉下层液体,向上层截留溶液中加入400μL超纯水14000rpm离心2min,再重复一次,吸取全部上层截留溶液至离心管中(或为了将液体转移干净,可将内管倒置于新的外管,14000rpm离心2min)(可测试蛋白浓度,并调整至合适浓度,进行N-糖的测试)。
• 为了您的安全健康,请穿实验服并佩戴手套操作。
• 每次取用时请使用洁净的移液枪头。
• 请按照说明书保存和使用相关试剂。
• 纯化模块中含有乙腈,易燃,有毒,使用时需严格遵守安全规范,应当由经过培训、有能力处理此类物质的专业实验室人员使用,产品的安全使用完全由采购方和用户负责。建议(1)通风:操作需在通风橱或充分排风的场所进行,避免蒸气积聚;(2)个人防护:需要佩戴防毒面具、化学防护眼镜等;(3)远离明火、热源及氧化剂(如过氯酸盐),储存温度≤30℃,相对湿度≤80%,与酸类、碱类、易燃物隔离存放;(4)泄漏应急处理:小量泄漏应用活性炭吸附或用大量水冲洗,废水需专业处理;(5)避免皮肤接触,若出现恶心、呕吐、胸闷、抽搐,需立即就医。

