PciI 属于 Type IIP 型限制性内切酶,来源于柠檬色动性球菌(Planococcus citreus),经大肠杆菌重组表达后获得。PciI 使用专属反应缓冲液 Cut Buffer C,可实现快速酶切;可兼容 CutFlex 缓冲液进行双酶切,但长时间反应可能出现星号活性。

同裂酶:PscI
注:同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。
图标注释
最适反应温度为 37℃
对于被 EcoKI 甲基化的 DNA,剪切可能受阻
对于被 EcoBI 甲基化的 DNA,剪切可能受阻
失活条件为 80℃温育 20min
产品信息
| 产品名称 | 货号 | 包装规格 |
|---|---|---|
| PciI | HSM052061 | 200 U |
产品组分
| 组分 | 规格 |
|---|---|
| PciI (10 U/μL) | 20 μL |
| 10×Cut Buffer C | 1 mL |
运输及保存方法
-25~-15℃运输与保存。
建议反应条件
1. 1×Cut Buffer C;
2. 37℃温育;
3. 参照“DNA 酶切流程”配制反应体系。
失活条件
80℃温育 20min。
活性定义
1 活性单位(U)是指在 50μL 反应体系中,37℃ 1h 内完全酶切 1μg p615 所需的酶量。
质量控制
功能活性检测:37℃下,10U PciI 能够在 15min 内完全消化 1μg p615。
超长时间温育检测:37℃下,将 10U PciI 与 1μg p615 共同温育 3h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解。延时酶切可能出现星号活性。
酶切-连接-再酶切检测:37℃下,使用 10U PciI 消化底物,回收酶切产物。在 22℃下使用适量 T4 DNA Ligase (Fast)可以将酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开连接产物。
使用方法
1. DNA 酶切流程
1) 在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:
| 组分 | 体积 |
|---|---|
| ddH2O | up to 50 μL |
| 10×Cut Buffer Ca | 5 μL |
| 底物 DNA | 1 μg |
| PciI (10 U/μL) | 1 μL |
| Total | 50 μL |
a.DNA 底物中应不含苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、洗涤剂或高浓度盐,否则将会影响 PciI 酶活性;
2) 轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋), 然后瞬时离心以收集挂壁液滴;
3) 37℃温育 15min~1h;
4) 80℃温育 20min 即可使酶失活,停止反应,或者通过吸附柱或苯酚/氯仿纯化终止反应。
2. 注意事项
1) 反应体系中加入的酶体积不应超过总体积的 10%,避免酶中过多的甘油引起星号活性;
2) 限制性内切酶存储缓冲液中的添加剂(例如甘油、盐)与底物溶液中的污染物(例如盐、EDTA 或乙醇等)相同,反应体积越小,酶切反应抑制效应越强。
3) PciI 可以和其他限制酶使用 CutFlex 缓冲液进行双酶切,但不建议长时间(超过 3h)反应。
不同 DNA 中的酶切位点数量
| DNA | 酶切位点数量 |
|---|---|
| λDNA | 2 |
| ΦX174 | 0 |
| pBR322 | 1 |
| pUC57 | 1 |
| pUC18/19 | 1 |
| SV40 | 0 |
| M13mp18/19 | 3 |
| Adeno2 | 9 |
甲基化修饰影响
| Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
|---|---|---|---|---|
| 无影响 | 无影响 | 无影响 | 剪切受阻 | 剪切受阻 |
在不同反应缓冲液中的活性
| CutFlex Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB rCutSmart™ Buffer | Takara QuickCut™ Buffer |
|---|---|---|---|
| 50% | <12.5% | 50% | 12.5% |
注:活性数据来自瀚海限制酶标准反应体系下的检测。
