本产品是一款适用于多种类型样品的快速鉴定试剂盒,包含DNA粗提取及PCR扩增体系。本产品可用于从植物的根、茎、叶等组织样本的直接扩增。可直接将组织用 Lysis Buffer 简单裂解处理后进行 PCR 扩增,无需酚氯仿抽提或柱式纯化等操作,使用简便,极大缩短实验耗时。产品适用于 3kb 以内目的片段的扩增。
本产品所提供的 2×Plant Direct PCR Mix 中,包含经过基因工程改造的 DNA 聚合酶、Mg2+、dNTPs 及优化的缓冲体系,具有极高的扩增效率和抑制物耐受度,使用时只需加入模板和引物,并补水至 1×即可进行 PCR 反应,使用本产品扩增的 PCR 产物 3′端带有一个突出的“A”碱基,纯化后可直接用于 TA 克隆。
产品信息
| 产品名称 | 货号 | 规格 |
|---|---|---|
| 植物直接扩增试剂盒 | HSM020021 | 5×1mL |
产品组分
| 组分 | 规格 |
|---|---|
| 2×Plant Direct PCR Mix | 5×1.0 mL |
| Direct Lysis Buffer | 60 mL |
| Dilution Buffer | 20 mL |
| Positive Control Primer Mix(10 μM each)* | 20 μL |
*阳性对照引物:用于阳性对照反应。该引物可以以维管植物基因 rcbL 序列为模板扩增出长度为 650 bp 左右的片段,推荐每次实验时至少设置一组阳性对照,Tm:55~60℃。
产品特点
(1)操作简便:无需提取基因组 DNA;
(2)适用广泛:适用于多种植物组织的直接扩增。
适用范围
本产品适用于基因敲除分析、转基因检测、基因分型等。
实验流程
1. 基因组 DNA 的释放:取适量植物组织样品于干净的离心管中,向每个离心管中加入 100 μL Direct Lysis Buffer,确保组织浸于裂解液中后 98℃孵育 30s。裂解上清液吹打混匀后可作为模板直接用于 PCR 扩增。
| 组织类型 | 推荐用量 |
|---|---|
| 植物组织 | 1~3mm |
注:模板建议现裂解现用,如需必要保存,可将上清液转移至另一个无菌离心管中,并等量加入 Dilution Buffer 混匀后置于-20℃保存,保存时间为 2 周。
2. PCR 扩增:将 2×Plant Direct PCR Mix 从-20℃取出后置于冰上解冻,上下颠倒混匀后按下表配制 PCR 反应体系(冰上操作):
| 组分 | 25 μL体系 | 50 μL体系 | 终浓度 |
|---|---|---|---|
| 2×Plant Direct PCR Mix | 12.5 μL | 25 μL | 1× |
| Primer 1(10 μM) | 1.0 μL | 2.0 μL | 0.4 μM |
| Primer 2(10 μM) | 1.0 μL | 2.0 μL | 0.4 μM |
| 裂解产物* | 1.0 μL | 1~2 μL | |
| ddH2O | Up to 25 μL | Up to 50 μL |
*加入量不应超过体系的 1/10,加入量过高时可能会抑制 PCR 扩增。
PCR 条件
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
|---|---|---|---|
| 预变性 | 94℃ | 5min | 1 |
| 变性 | 94℃ | 30s | 35~40 cycles |
| 退火* | Tm+3~5℃ | 30s | |
| 延伸 | 72℃ | 30s/kb | |
| 终延伸 | 72℃ | 5min | 1 |
| - | 4℃ | Hold | - |
*退火温度:参考引物 Tm 值,建议退火温度设置为引物中 Tm 较小值+3~5℃。
常见问题与解决方法
1. 无目的条带
(1)裂解产物过量。选择最合适的模板用量,一般不超过体系的 1/10;
(2)取样量过大。将裂解产物稀释 10 倍后扩增,或减少取样量重新裂解;
(3)组织样品不新鲜。建议使用新鲜的组织样品;
(4)引物质量差。使用基因组 DNA 进行扩增验证引物质量,优化引物设计。
2. 出现非特异扩增
(1)退火温度过低、循环数过高。提高退火温度,减少循环数;
(2)模板浓度太高。减少模板用量或将模板稀释 10 倍后扩增;
(3)引物特异性差。优化引物设计。
注意事项
1. 为了避免样品间出现交叉污染,需准备多个取样工具,如需反复使用可在每次取样后用 2%次氯酸钠溶液或核酸清洁剂对工具表面进行清洁;
2. 建议使用新鲜采取的植物组织,取样量不宜过大,以避免影响扩增结果;
3. Lysis Buffer 的保存条件为 2~8℃,若低温保存可能会出现沉淀,在使用前务必充分溶解;
4. PCR Mix 应避免反复冻融,短期内多次使用可置于 4℃保存;
5. 本产品仅限于科学实验研究使用,不得用于临床诊断、治疗等领域。
