将改良的胍盐提取方法和柱法纯化技术结合起来,适合于从各种植物/真菌样品,特别是富含多糖多酚的植物组织(如棉花叶片、成熟水稻叶片、拟南芥种子,白松松针,枇杷叶片,月季等)中提取高纯度的 RNA。得到的 RNA可直接用于 RT-PCR、Northern Blot、polyA +纯化、核酸保护和体外翻译等实验。
产品信息
| 产品名称 | 货号 | 规格 |
| 通用植物RNA试剂盒-常规和多糖多酚类植物 | HSM010141-01 | 24T |
| HSM010141-02 | 100T |
产品组分
| 组分 | HSM010141-01 | HSM010141-02 | 主要组分 | 组分功能 |
| 纯化次数 | 24 | 100 | / | / |
| 纯化柱 B10 | 48 | 2×100个 | 玻璃纤维滤膜 | 吸附核酸 |
| 2mL收集管 | 48 | 2×100个 | 塑料管 | 收集滤液 |
| Buffer RLF | 20mL | 80mL | 胍/Triton X-100 | RNA裂解液 |
| Buffer PAL | 20mL | 80mL | CTAB/NaCl/Tris | RNA裂解液 |
| Buffer RW1 | 15mL | 60mL | 异硫氰酸胍/乙醇 | 洗涤除蛋白 |
| Buffer RW2 | 6mL | 25mL | Tris/NaCl/乙醇 | 洗涤除盐离子 |
| RNase Free Water | 10mL | 20mL | DEPC处理水 | 洗脱液 |
准备事项
按瓶子标签所示,加入 4 倍体积的无水乙醇稀释 BufferRW2,室温保存。
实验流程
A.多糖多酚类
1. 样品研磨:用液氮将植物或真菌研磨成粉末,称取 50-100mg 粉末至 2.0mL 离心管中。立即加入 0.7mL Buffer RLF 至样品中,立即涡旋 10~15 秒让样品充分分散。
(1)使用前按1mL BufferRLF加入50µL 2--巯基乙醇,混合液室温可以保存 1 周。由于巯基乙醇气味很重,可用无气味的还原剂 TCEP代替。
(2)研磨好的样品在称量、转移、存放或加入 RLF 之前都不能解冻,否则 RNA 会降解。加入 Buffer RLF 后要立即涡旋 10-15 秒让样品充分分散,成团样品用移液器吸打辅助分散,然后再进行第二个样品研磨操作。
(3)处理易研磨植物样品(水果果实/鲜嫩叶片等),直接转移 50~100mg 样品和 0.8mLBufferRLF 至研钵中研磨或电动匀浆器研磨,然后转移 0.7mL 匀浆液至离心管中,按第二步进行操作。
(4)受植物样品多样性影响,且生不同生长发育阶段组织 RNA 含量差异显著,初次实验时,常规植物或多酚类样品用 50mg,富含粘液质的组织样品用 30mg 进行提取,根据实验结果调整样品用量,但最高不建议超过100mg。
(5)淀粉类样品:如水稻种子、根块富含淀粉的样品,BufferRLF 会引起淀粉糊化造成裂解液粘稠固化。处理这种样品时,使用方案 B。
(6)失败样品:由于植物中代谢物质含量差异很大,本方案虽然解决大部分的样品部分,但本产品未能解决问题,请尝试使用方案 B。方案 B 采用经典的 CTAB 裂解液,提供了另一种解决方案。
2. 室温下,13,000×g 离心 3 分钟。
3. 去除 DNA:把纯化柱 B10 装在收集管中。转移 0.6mL 上清液至纯化柱 B10 中,13,000×g 离心 1 分钟。
4. 调整 RNA 结合条件:弃去纯化柱 B10(含DNA)。加入 0.4 倍无水乙醇(~240µL)至滤液管中,涡旋混匀10秒或用移液枪吸打3~5次。
5. 吸附 RNA:取新的纯化柱 B10 装在收集管中,转移全部混合液至柱子中。13,000×g 离心 1 分钟。若出现堵柱现象,离心速度调至 14000-16000×g 并延长离心时间直至全部溶液滤出。
6. 除蛋白质:倒弃滤液,把柱子装回收集管。加入 500µL BufferRW1 至柱子上。13,000×g 离心 1 分钟。
7. 脱盐:倒弃滤液,把柱子装回收集管。加入 500µL Buffer RW2 至柱子中,13,000×g离心 1 分钟。
8. 脱盐:倒弃滤液,把柱子装回收集管。加入 500µL Buffer RW2 至柱子中,13,000×g离心 1 分钟。
9. 干燥:倒弃流出液,把柱子装回收集管。13,000×g 离心 2 分钟。
10. 洗脱:将柱子转移至 1.5mL 离心管,加入 30-100µL RNase Free Water 至柱子膜中央。室温静置 2 分钟。13,000×g 离心 1 分钟。弃去柱子,把 RNA 保存于-80℃。洗脱液体积不应少于 30µL,体积过小影响洗脱效率。如 RNA 得率超过 30µg,可重复第10 步洗脱步骤,重复时可以用新的 RNaseFree Water 液或洗脱液进行第二次洗脱。
B.(淀粉类,或疑难样品)
1. 裂解样品:用液氮将植物或真菌磨成粉末,称取 50~100mg 粉末至 2.0mL 离心管中,加入 0.7mL Buffer PAL 至样品中,立即剧烈涡旋充分打散样品,65ºC 放置 5~10 分钟。
•处理易研磨的植物样品(水果果实/鲜嫩叶片等),转移 100~150mg 样品至研钵中,加入 1.0mL Buffer PAL/2-巯基乙醇至研钵中,立即进行充分的研磨,然后转移 0.8mL 匀浆液至 2.0mL 离心管中,65ºC 放置 5~10 分钟,按第 2 步进行操作。
•Buffer PAL 使用前,加入 2-巯基乙醇至1%(V/V),难提取样品可以提高至 5%。粘稠样品可以适当增加 BufferPAL 用量。
2. 除杂:加入 0.7mL 氯仿,涡旋混匀 15 秒,室温下,13,000×g 离心 5 分钟。油脂和蛋白质类种子类样品用酚氯仿代替氯仿抽提效果更好。
3. 调结合条件:转移 0.5mL 上清液至离心管中,加入 0.5 倍无水乙醇,涡旋混匀 10 秒。若这一步出现明显絮状沉淀,用移液器吸打数次打散沉淀。
4. 吸附总核酸:把纯化柱 B10 装在收集管中。转移混合液(含沉淀)至纯化柱 B10 中,13,000×g 离心 1 分钟。
5. 洗出 RNA:倒弃滤液,把柱子装在新的收集管中,加入 500µL Buffer RLF 至柱子中,静置 1~3 分钟,13,000×g 离心 1 分钟。
6. 调节结合条件:弃去纯化柱 B10,加入250µL 无水乙醇至滤液,吸打混匀 3-5 次。
7. 吸附 RNA:取新纯化柱 B10 装在旧收集管中,转移全部混合液至柱子中。13,000×g 离心 1 分钟。
8. 脱盐:倒弃滤液把柱子装回收集管,加入500µL BufferRW2 至柱子,13,000×g 离心 1分钟。
9. 脱盐:倒弃滤液把柱子装回收集管,加入500µL BufferRW2 至柱子,13,000×g 离心 1分钟。
10. 干燥:倒弃流出液,把柱子装回收集管。13,000×g 离心 2 分钟。
11. 洗脱:将柱子转移至 1.5mL 离心管,加入 30-100µL RNase Free Water 至柱子膜中央。室温静置 2 分钟。13,000×g 离心 1 分钟。弃去柱子,把 RNA 保存于-80ºC。洗脱液体积不应少于 30µL,体积过小影响洗脱效率。如 RNA 得率超过 30µg,可重复第11 步洗脱步骤,重复时可以用新的 RNaseFree Water 液或洗脱液进行第二次洗脱。
RNA 完整性和纯度检测
完整性检测:用 0.5×TBE 电泳缓冲液配制
1.2%琼指糖凝胶,RNA 上样量为 0.5~1.5µg,150V 电泳 15 分钟。电泳图上能看两条明显的rRNA 条带,其中 28S rRNA 的亮度好明显亮于 18SrRNA,表明 RNA 条带完整不降解。
1. 纯度 1:OD260/280 比值衡量蛋白质污染程度的指标。高纯度 RNA 的 OD260/280 比值为 2.0。由于 OD260,OD280,OD230 会受pH 值影响。本产品采用 RNase Free Water溶解(DEPC 处理水),其 pH5.5~7.5 波动,OD260/280 比值为 1.9-2.1。纯度2:当RNA总量高于10ug时,OD260/230一般都在 1.3-2.2;当 RNA 总量在 5~10ug 时,A260/230会在0.7~2.0;当RNA总量低于3ug,A260/230 会低于 0.6。这是因为 Buffer RLC和 BufferRW1 含异硫氰酸胍,以及玻璃滤膜有吸水性或本底吸附。异硫氰酸胍在 230nm有强烈吸光值,因此 A260/230 主要受该胍盐影响,而不是来源于样品。研发表明,低浓度异硫氰酸胍不影响反转录,定量 RT-PCR,二代测序等相关应用。出现 260/230 在 0.2-1.0时,可以忽略并直接用于反转录等下游应用。在不堵塞柱子的情况下,适量提高样品用量和裂解液用量,提高核酸浓度(核酸总量>10ug)时,OD260/230 可以明显改善。
注意事项
本产品仅限于科学实验研究使用,不得用于临床诊断、治疗等领域。
