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T4 RNA连接酶2
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T4 RNA连接酶2

英文名称:T4 RNA连接酶2

  • 4285
100μL
HBP001103
500μL
HBP001104
50mL
HBP001107
100mL
HBP001108

货号:HBP001103、HBP001104、HBP001107、HBP001108

运输及保存方法:-25~-18℃保存。
Storage Buffer: 10mM Tris-HCl(pH7.5) ,50mM KCl, 35mM(NH4)2SO4, 0.1mM EDTA,0.1mM DTT,50%(v/v)Glycerol. 

10×Reaction Buffer: 500mM Tris-HCl (pH7.5), 20mM MgCl2, 10mM DTT,4mM ATP. 

失活或抑制:85ºC 加热 5min 可使 T4 RNA Ligase 2 失活,也可加入蛋白酶 K 或 EDTA 抑制其活性。

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T4 RNA Ligase 2,即 T4 RNA 连接酶 2,是一种 ATP 依赖的双链 RNA 连接酶(double-strand RNA ligase,dsRNA Ligase),也被称为 T4 Rnl2,可以用于双链 RNA 进行分子内的环化连接和分子间的线性连接。T4 RNA Ligase 2 与 T4 RNA Ligase 1 不同的是,对双链 RNA 中 nick 的连接活性要大大高于对单链 RNA 末端的连接活性。T4 RNA Ligase 2 也可用于双链核酸(RNA 双链、RNA/DNA 杂合链或 DNA 双链)分子内或分子间 RNA 链的 3′羟基和 DNA 链的 5′磷酸基的连接。T4 RNA Ligase 2 连接时需要 5′磷酸和 3′羟基的存在,可以使 RNA 链或 DNA 链的 5′磷酸基和 RNA 链的 3′羟基之间发生连接反应。主要用于连接双链 RNA 中缺刻的连接(即双链 RNA 的粘端连接),也可用于双链结构中,RNA 3′羟基与 DNA 5′磷酸基的缺刻连接。T4 RNA Ligase 2 为大肠杆菌表达的重组蛋白,表达基因的来源为 T4 噬菌体。


产品信息

产品名称货号规格
T4 RNA 连接酶 2HBP001103100 μL
HBP001104500 μL
HBP00110750 mL
HBP001108100 mL


产品组分

组分HBP001103HBP001104HBP001107HBP001108
T4 RNA Ligase 2(10 U/µL)100 µL500 µL50 mL100 mL
10× Reaction Buffer300 µL1500 µL150 mL300 mL
RNase-Free ddH2O1 mL5 mL500 mL1 L


单位定义

一个单位的定义是在 37℃下,在 20 µL 的体系中,30 分钟内连接 0.4 µg 23-mer 和 17-mer RNAs 的等摩尔混合物所需的酶量。


质量控制

无 RNase、DNase 污染。

经考马斯亮蓝染色的 SDS-聚丙烯酰胺凝胶染色判断,T4 RNA 连接酶 2 纯度>90%。


使用说明

1)双链 RNA 或 DNA/RNA 杂合双链的底物制备:将 RNA 混合物或 DNA 和 RNA 的混合物(按摩尔质量比 1:1 混合),推荐的终浓度为 20 µM(10~50 µM 均可),65℃孵育 3 min,然后冰上孵育 2 min。

2)双链结构中 RNA 3′羟基和 DNA 5′磷酸基连接的反应体系(于冰盒上配制):

组分添加量终浓度
RNase-Free ddH2OUp to 20 µL
Nicked DNA/RNA SubstrateX µL1 µM
10× Reaction Buffer2 µL
50% PEG 80004 µL10%
MgCl2(100 mM)1.6 µL8 mM
T4 RNA Ligase 2(10 U/µL)1 µL0.5 U/µL
Total20 µL

3)对于双链 RNA 缺刻的连接,使用 T4 RNA Ligase 2 连接的反应体系(于冰盒上配制):

组分添加量终浓度
RNase-Free ddH2OUp to 20 µL
Nicked DNA/RNA SubstrateX µL0.5 µM
10× Reaction Buffer2 µL
T4 RNA Ligase 2(10 U/µL)1 µL0.5 U/µL
Total20 µL


反应条件

连接反应:37℃孵育 30 min。如果发现效果欠佳可以尝试 25℃孵育 2 h。为了使连接反应更加充分,可以适当延长连接反应时间。

终止反应*:反应结束后加入蛋白酶 K 或 EDTA,即可终止反应。

*由于 T4 RNA Ligase 2 热失活需要 85℃加热 5 min,这样可能导致 dsRNA 或 DNA/RNA 杂合双链变性,因此通常不建议通过加热方式失活 T4 RNA Ligase 2。如果后续无需保持双链状态,则推荐 85℃加热 5 min 以失活 T4 RNA Ligase 2。


注意事项

1. 由于涉及 RNA 操作,需要严格按照 RNA 操作的规范进行,避免 RNase 污染,相关试剂和耗材需要经过 DEPC 处理去除 RNase 或者确保是 RNase free 的。本反应体系中涉及双链 RNA,双链 RNA 可以耐受 RNase A 和 RNase T1 等。如果涉及单链 RNA,包括 dsRNA 制备后存在部分 RNA 序列是单链的情况,可以考虑适量添加 RNase Inhibitor;

2. 如果同时进行多个连接反应,可以把上表中除 Nicked dsRNA Substrate 之外的所有溶液和酶提前预混合,然后再分装到各反应管内。可根据具体应用选择合适的操作方法,可能需准备额外的试剂,如 RNase inhibitor、DEPC 水等;

3. 反应体系中的 Nicked dsRNA Substrate 的最终浓度可以达到 1 µM,在该反应体系中可以确保充分连接。实际使用过程中,例如由于底物量有限等原因,可以适当减少 Nicked dsRNA Substrate 的用量,例如使最终浓度为 0.5 µM 或 0.2 µM 等;

4. 本产品仅限于专业人员科学研究用,为了您的安全健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

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